承襲著2002年APEC領袖在墨西哥Los Cabos共同發表的反恐聲明〈Leader，s Counter-Terrorism Statement〉之指示，2003年APEC在推動反恐議題，除重視安全和貿易便捷化的不可分割性外，也積極推動足以實現領袖反恐聲明的新措施。

今年2月第一次「APEC區域貿易安全」（STAR）會議在泰國Chiang Rai舉行，共商對抗恐怖主義活動之對策，會中決定由公部門及私部門聯手對抗區域暨全球的恐怖主義活動威脅，以確保貿易活動貨物、人員的流通和安全。第一次STAR會議，則將於2004年在智利舉辦。

同月召開的APEC第一次資深官員會議，則同意在APEC架構下設置一個為期2年的「反恐任務小組」（Counter-Terrorism Task Force）， 以提升對反恐議題有效的討論，並協調國際間不同組織（包括聯合國安理會所屬反恐委員會、G-8反恐行動小組等）關於推動反恐措施。該任務小組的任務在蒐集各經濟體的反恐資源和資訊，協調反恐能力建構及技術合作。

該次APEC資深官員會議中還通過由馬來西亞提出的「反恐行動計畫」（Counter-Terrorism Action Plan），希望各經濟體能在第三次資深官員會議時完成填表工作。該行動計畫附有各經濟體執行反恐措施的check-list。內容涵蓋加強APEC區域貿易安全、保護國際海運的船隻安全、保護國際航空安全、保護人員運輸安全、杜絕恐怖主義資金、推動較佳選擇匯款系統和非營利機構、強化反恐管制能力的法律、推動電腦安全、能源安全、保護社區民眾健康安全等。

今年7月，美國向APEC「反恐任務小組」提出「供應鏈安全綱領」（Supply Chain Security Guideline），希望確保區域甚至全球經濟產業和貿易運輸等每一個環節的安全。雖然該綱領在性質上屬於non-binding，但今年10月APEC部長會議仍將鼓勵所有經濟體能實現該綱領的內容。

今年9月在普吉島舉行的APEC財政部長會議，財長們呼籲亞太經濟體共同團結合作，以斷絕國際恐怖組織和恐怖份子的資金取得，才能確保亞太區域安全，以及加速經濟復甦。

APEC為了強化各經濟體克服恐怖主義威脅的能力，也陸續展開許多反恐能力建構的活動，包括今年9月在馬尼拉召開的海事安全合作高階會議、10月在溫哥華召開的APEC Smart Border Symposium，以及在東京召開的反洗錢/反恐怖主義金融政策研討會，還有利馬、聖地牙哥、墨西哥市和莫斯科等城市的電腦緊急應變團隊的能力建構等。

反恐議題在今年曼谷的APEC部長會議和領袖會議仍將是主要議題之一。部長們將會支持上述所提及的各種反恐措施和能力建構，而領袖們將會重申反對任何形式的恐怖主義，並再次承諾提昇APEC區域貿易安全之行動、促進網路安全、阻斷恐怖主義資金流動，徹底反擊恐怖主義對所有團體和個人安全的威脅。